El Presidente de la Junta Directiva es nombrado por el Presidente de la República.
Ocho Directores, cuatro propietarios y cuatro suplentes, son nombrados por el Órgano Ejecutivo en los ramos de Obras Públicas, Hacienda, Economía y Defensa Nacional.
Cuatro Directores, dos propietarios y dos suplentes, son nombrados por el Órgano Ejecutivo en el ramo de Obras Públicas, de dos ternas que para el efecto le son presentadas así: una por los agricultores e industriales organizados en asociaciones reconocidas legalmente; y la otra por los comerciantes organizados y reconocidos en la misma forma.Para tal fin, el Ministerio de Obras Públicas califica esas asociaciones por medio de un acuerdo.
La Junta Directiva ha nombrado como su secretario de actas al Gerente General de CEPA.
La Junta Directiva de CEPA, de acuerdo a su Ley Orgánica vigente, está integrada por un Presidente y doce Directores, nombrados en la forma siguiente:
PRESIDENTE DE JUNTA DIRECTIVA: LIC. FEDERICO ANLIKER
DIRECTORES PROPIETARIOS:
1. ING. SAÚL ANTONIO CASTELAR CONTRERAS
POR EL RAMO DE OBRAS PÚBLICAS
2. JOSÉ ALEJANDRO ZELAYA VILLALOBOS
POR EL RAMO DE HACIENDA
3. FRANCISCO JOSÉ SOL SCHWEIKERT
POR EL RAMO DE ECONOMIA
4. CNEL. MANUEL FABIO CALDERÓN
POR EL RAMO DE LA DEFENSA NACIONAL
5. SR. RICARDO ANTONIO BALLESTEROS ANDINO
POR EL SECTOR INDUSTRIALES
6. SRA. DALILA MARISOL SORIANO DE RODRÍGUEZ
POR EL SECTOR COMERCIANTES
DIRECTORES SUPLENTES:
1. ING. ALVARO ERNESTO O´BYRNE CEVALLOS
POR EL RAMO DE OBRAS PÚBLICAS
2. SR. MAURICIO ALBERTO SOLÓRZANO MARTÍNEZ
POR EL RAMO DE HACIENDA
3. SRA. YANCI YANET SALMERÓN DE ARTIGA
POR EL RAMO DE ECONOMIA
4. CAPITÁN DE NAVÍO EXON OSWALDO ASCENCIO
POR EL RAMO DE LA DEFENSA NACIONAL
5. (PENDIENTE DE NOMBRAR)
POR EL SECTOR INDUSTRIALES
6. SR. MARVIN ALEXIS QUIJADA
POR EL SECTOR COMERCIANTES
Junta directiva, septiembre 2019